El colegio Nuestra Señora de Nazareth es fundado por la Hna. María Magdalena Pulido Alvarado en el año 1953, con el aval de la Madre María Sara Alvarado Pontón, fundadora de la congregación de Dominicas Hijas de Nuestra Señora de Nazareth, como respuesta a la situación de marginación socio-cultural de la niñez y la juventud femenina.

La Hna. rectora María Magdalena plantea como uno de sus fines la formación integral y ante la creciente demanda de estudiantes, solicita y obtiene en 1959, ante el MEN, la aprobación oficial del nivel de secundaria con cuatro grados como normal rural. En 1960  la Hna María Amparo Pulido, como rectora, amplía el servicio a normal elemental y en 1962 proclama la primera promoción de normalistas superiores; como Normal piloto, la Institución es elegida por el MEN para liderar la reforma de las normales, y como consecuencia se crea el ciclo profesional normalista en 1967, con  el nombre de Escuela Normal Nuestra Señora de Nazareth; posteriormente, como consecuencia del acelerado crecimiento de demanda de la población estudiantil en Bosa, se da apertura al ciclo de educación media académica y se cambia la razón social de Normal por la de Colegio Nuestra Señora de Nazareth; no obstante, se sigue con la modalidad pedagógica.

En 1977, siendo rectora la Hna. Fanny Aurora Parra, se da impulso al nivel de preescolar y en el 1978 lidera  la celebración de las bodas de plata; en 1987 la Hna. Gemma del Sagrario Mahecha obtiene la aprobación del MEN del bachillerato en la modalidad de salud y nutrición; también crea el centro médico como apoyo a esta modalidad. Entre los años 1989 y 1993 las Hnas. Edelmira Castillo y Amira Palomar lideran la construcción del auditorio, la cafetería y la adecuación y dotación de laboratorios.
          
En 1995, con la reestructuración de las normales, se declara la inviabilidad del proyecto en el colegio, por la escasez de recursos económicos, y se determina el cierre de la modalidad pedagógica. En 1997 se adopta la modalidad de gestión administrativa. En el año 2000 la Hna. Raquel Moreno promueve procesos de formación del personal en gestión integral para la calidad, la productividad y la competitividad; se firma el contrato con la SED, que contribuye a solucionar la demanda de cupos y ampliación de cobertura, y se participa en el concurso Galardón a la Excelencia Santafé de Bogotá, experiencia que permite, en una autoevaluación, identificar fortalezas y debilidades para mejorar los procesos. En el 2001 la Hna. Julia Omaira Ramírez gestiona la adquisición del laboratorio de idiomas y en el 2002  se inicia la construcción de la nueva sede para el nivel de preescolar y primaria, se remodela la recepción y se dota al auditorio de luces para el escenario.

En el  2003 la Hna. María Stella Sánchez promueve el cambio a jornada única, se reubican y adecuan el centro médico, la sala de idiomas y se inaugura la sede “Madre María Sara Alvarado”; en este año se realiza el “I Congreso Internacional de Educación”, con motivo de la celebración de los 50 años del colegio,  con la participación de delegaciones de diferentes países y de personalidades,  como Daniel Bogoya, director del Icfes,  y  del alcalde mayor de Bogotá,  Antanas Mockus, quien inauguró el evento.

A partir del año 2003 hasta la actualidad se sigue profundizando en la implementación del modelo de gestión integral y la aplicación de herramientas, técnicas e instrumentos propios de este esquema;  se consolida la estandarización de procesos representados en flujogramas, se estructura el horizonte institucional, se perfeccionan los indicadores, se elaboraran las directrices anuales respectivas y se propicia una cultura del trabajo en equipo, el empoderamiento y el despliegue. Igualmente,  se continúa con la formación sistemática del modelo pedagógico del currículo problémico y de modificabilidad cognitiva estructural, que exige nuevas formas de práctica pedagógica en aula de impacto en la formación integral, la investigación y el  desarrollo de competencias de las estudiantes.